Într-un interviu din 2016, Pete Hegseth a afirmat că militarii americani nu trebuie să urmeze ordine ilegale, inclusiv dacă acestea ar veni de la președintele în exercițiu, poziție pe care a reiterat-o și recent.
Controversele actuale privind atacuri militare în Caraibe și reacțiile politice din SUA au adus în discuție această temă, inclusiv acuzații de execuții extrajudiciare și răspunsuri contradictorii.
Pe de o parte, Hegseth susține că Trump are autoritatea să ia decizii militare, pe de altă parte a arătat că armata are obligația să refuze ordinele ilegale, alături de criticile făcute parlamentarilor democrați care îndeamnă la aceeași atitudine.